南通市中医院始建于1956年，是首批“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”之一、南京中医药大学南通附属医院和南通大学附属中医院。先后荣获“全国红旗单位”、“全国医药卫生先进集体”、“国家中医药局创先争优先进集体”、“省、市文明单位”、“省抗非先进集体”、“江苏省五一劳动奖状”、“省院务公开先进集体”、“省、市医院管理年活动先进单位”、“南通市服务经济建设最佳单位”、“南通市先进基层党组织”、“市十佳医院”、“无红包医院”等称号。

　　医院科室设置齐全，人才济济，设备先进，专科特色显著。共有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张。医院现有职工1073人，具有高级职称者196人，硕博士144人。已故的朱良春先生为国医大师。有全国名中医2人、省名中医3人、市名中医12人、享受国务院专家特贴6人。全国及省名老中医药专家带徒13人，全国优秀中医研修人才7名，省中医药领军人才1名，省333工程第三层次培养对象1名。国家级名医工作室2个，分别是国医大师朱良春学术经验传承研究室和邵荣世学术传承名医工作室。
　　目前，中医外科为国家中医药管理局重点专科；外科为国家卫计委中医临床重点专科建设单位、脾胃病科为国家中医药管理局重点专科建设单位；中医外科学和中医脾胃病学通过“十二五”江苏省中医药重点学科验收。脾胃病科、骨伤科、妇科，肺病科、肾病科为省重点专科，风湿病科为省重点建设专科。另有11个市级重点专科。
　　建院以来，先后荣获科研成果奖近150项，其中“季德胜蛇药片”、“拔核疗法治疗瘰疬”、“新药金荞麦”为国家级成果。出版著作37部。
　　医院连续多年实现跨越式发展。时任国家卫计委副主任、国家中医药管理局局长王国强、国家卫计委副主任马建中等领导曾先后多次来院指导，充分肯定医院各项工作取得的成绩，并对今后发展提出殷切期望。
　　南通市中医院人正以“继承、创新、求实、奋进”的精神风貌，向着现代化中医院的目标迈进！