常州市妇幼保健院筹建于1981年， 先后完成与常州市妇幼保健所、常州市计划生育指导所的合并。经过30多年的发展，现集医疗、保健、教学、科研于一体，2007年被卫生部授予三级甲等妇幼保健院，2010年成为南京医科大学附属常州妇幼保健院，是首批国家级“爱婴医院”，先后获得“全国妇幼卫生工作先进单位”，省、市“文明单位”，“市先进基层党组织”等多项荣誉称号。2011年获得“全国地市级妇幼保健机构运营与发展状况综合指标排名第七位”，2012年8月通过了省卫生厅“三甲”复核评审。在注重医疗保健、学科发展的同时，加强道德文化建设，是常州市卫生系统首批道德讲堂示范点，在2013年省卫生厅101家三级医院满意度函调中，获得了全市第3名，全省第30名的好成绩，2014年被评为常州市“三八”红旗集体。2015年授予常州市五一劳动奖状，院党委被评为常州市先进基层党组织。2016年医院被评为2013-2015年度常州市文明单位。2017年被评为常州市妇女儿童工作先进集体、常州市卫生计生行业首批文化建设示范点、巾帼建功先进集体。
目前占地面积23153平方米，建筑总面积59815平方米。核定床位450张，职工902人，其中卫技人员773人。设置7个临床一级科室、6个保健一级科室、5个医技科室。年门诊诊疗达71余万人次，出院病人2.3万余人次，手术1.7万余人次，年分娩量达1.1万余人次。现已成为常州及周边地区妇、产、新生儿科疑难重症的诊治中心，建有妇科、围产医学、新生儿科三个市级临床医学重点专科；产科是常州市医学重点专科及重点学科，妇科是江苏省临床重点专科、常州市医学重点专科及重点学科建设单位；妇女保健科、妇产医学、遗传医学、新生儿科四个省妇幼重点学科；还建有“江苏省新生儿疾病筛查中心常州分中心”、“常州市产前诊断中心”、“常州市生殖医学中心”“常州市高危孕产妇救治中心”、“常州市早产儿救治中心 ”“常州市PAC(流产后关爱)联盟”等。拥有硕士及以上学历人才152名，其中博士7名，在读博士13名；江苏省、常州市各类人才10多名。
妇科是江苏省临床重点专科、常州市医学重点专科及重点学科建设单位、南京医科大学校重点学科。设有妇科肿瘤、普通妇科、宫颈疾病专科，主要开展妇科肿瘤、妇科内分泌、盆底结构重建及女性生殖系统炎症等疾病的全面诊治。妇科广泛开展微创技术，是常州地区两家具有四级妇科腔镜手术资质的单位之一。宫颈疾病专科被卫生部列为常州地区唯一的子宫颈癌预防及癌前病变规范化诊断与治疗示范点。
产科是常州市医学重点专科及重点学科。设有普通产科、病理产科共6个病区，承担了常州市区1/2的分娩工作量，并承担全市产科技术的基层指导和培训考核工作。产科在重度妊高症、妊娠期肝内胆汁瘀积症、妊娠期糖尿病等多种高危妊娠的诊治方面积累了丰富的经验。开展了笑气吸入、镇痛分娩、气囊助产、导乐分娩、水中分娩以及温浴减痛分娩等技术，为广大孕妇提供了更多的分娩方式选择。
新生儿科是江苏省妇幼保健重点学科、常州市重点专科，在治疗重危新生儿如新生儿重度窒息、呼吸窘迫综合征、多脏器功能衰竭、早产低体重儿及早产超低体重儿等的救治方面积累了丰富的临床经验，成功救治体重低于1000g的极低体重早产婴儿50余例，其中，救治成功的最低体重患儿仅730g，最低孕周患儿仅24+1周。
生殖医学中心是常州市唯一由江苏省卫生厅批准的人工助孕医疗机构，主要针对各种不孕不育症的诊治及辅助生殖医学领域的临床与科研。2004年全面开展“第一代试管婴儿”技术、“第二代试管婴儿”技术以及冻融胚胎移植技术，迄今完成5330多周期。
产前诊断中心是常州市唯一由江苏省卫生厅批准的产前筛查/诊断技术服务机构。通过遗传学和影像学检查，对高风险患儿进行明确诊断，从而降低出生缺陷率，提高出生人口素质。
新生儿疾病筛查中心是常州市唯一由江苏省卫生厅批准的新生儿疾病筛查机构。系统开展包括先天性甲状腺功能减低症、苯丙酮尿症、先天性肾上腺皮质增生症的筛查和早期诊断，为早期干预和预防残障提供有效的手段和依据。
保健部设有群体保健科、妇女保健科、生殖保健科、青春期保健科、儿童保健科及口腔保健科等一级科室。负责常州地区母婴保健技术监管、孕产妇保健管理、儿童保健管理、助产机构评审与监管、托幼机构监管及妇幼卫生重大项目实施等。
医院全力实施“名医、名科、名院”战略，全院职工始终秉承“诚信、敬业、和谐、创新”的医院精神，全力打造服务品牌，努力实现三个满意：患者满意、社会满意、职工满意。
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