曹县人民医院始建于1949年，是一所集医疗、教学、科研、急救于一体的大型综合三级乙等医院，为曹县基本医疗保险、离休干部定点医院，获有国家爱婴医院、省级文明单位、山东省优质服务百佳医院、全省临床输血先进单位等荣誉。
医院拥有两个院区：老院位于曹城办事处闽江路健康新村1号，占地面积4.6万平方米，建筑面积3.5万平方米，业务用房2.2万平方米。老院区新建12层1.2万平方米综合病房楼于2013年7月29日投入使用。
新院位于曹县开发区青菏路东、富民大道南，按照三级医院标准规划建设，占地面积168亩，规划床位2000张，分三期建设。
一期为门诊楼、外科病房楼，总建筑面积2.4万平方米，其中门诊楼8000平方米，5层，于2012年2月29日投入使用。外科病房楼1.6万平方米，12层，开放床位350张，于2012年4月26日投入使用。
二期为内科病房楼，总建筑面积2.2万平方米，12层，开放床位450张，于2013年6月29号投入使用。
三期为门诊病房综合楼，该楼设计理念先进，集门诊、急救、医疗、体检、康复及特需医疗为一体，极大地优化了服务流程，数字化程度达省内领先水平，总建筑面积100148平方米，19层，开放床位1149张，预计2015年底投入使用。
现有17个医技科室和34个临床学科，开放床位1360张，现有人员1438人，其中博士1人、硕士44人、本科729人；高级职称95人、中级职称417人。2013年医院全年门诊量34.8万人次，出院病人4.5万人次，住院手术1万人次。
拥有西门子1.5T18通道超导磁共振、飞利浦64排128层螺旋CT、岛津数字胃肠、柯达DR、飞利浦DR、飞利浦IE33心脏彩超、西门子全身彩超、阿洛卡腹部彩超、日立7600全自动生化分析仪、贝克曼化学发光免疫分析系统、ABX血液分析仪、生物-梅里埃微生物鉴定及药敏分析系统、朗迈尿液工作站、amax20血凝仪、徕卡快速切片机、电子胃镜、电子结肠镜、手术显微镜、史赛克腹腔镜、奥林巴斯腹腔镜、全自动呼吸机、攀龙和迈瑞麻醉机等大型医疗设备100余(台)件。
学科建设：内科系统重症医学科(ICU)、血液净化科、心内介入?肾内科、心内一病区、二病区、内分泌、神经内一病区、二病区、三病区、呼吸内、消化内、中医、感染等学科；外科系统神经外、普外一病区(胃肠、血管、烧伤)、普外二病区(肝胆) ˙小儿外科、普外三病区(甲状腺、乳腺)、骨外一病区、二病区、三病区、胸外、泌尿外等学科；妇科、产科一病区、二病区、三病区；普儿科一病区、二病区、三病区、新生儿重症监护室(NICU)；五官科(耳鼻喉、口腔、眼)；120急救中心配有4辆福特救护车，具备24小时接诊病人能力；重症医学科(ICU)技术力量雄厚，监控、救治设备齐全。全院建有中心供氧、中心吸引系统。
为进一步体现“以病人为中心”的服务理念，优化服务流程，为患者就诊提供最大便利，医院成立了病员服务中心，设立综合服务大厅，将住院处、基本医疗保险、县外转诊等办公室整合到“一站式”服务大厅联合办公，让群众足不出厅就可办好相关手续，由病员服务中心为群众提供院前、院中、院后三大模块24项服务项目，将医疗服务从医院延伸到社区，让群众切实享受到便捷、人性化的医疗保障服务。
为提升医院管理水平，加强学科建设，该院与山东省千佛山医院紧密合作，成为山东省千佛山医院(集团)曹县医院。集团医院在医院管理、学科建设、人才培养、绩效考核、信息资源、医院文化等方面进行全方位合作，实现分级诊疗、多点执业、双向转诊、检查结果互认。全面提升医院管理和技术服务水平，打造集团医院优质医疗品牌，力争3-5年内达到三级甲等医院标准，成为鲁西南区域医疗中心。
2015年12月15日，山东省医院等级评审专家组组长孙强三宣布，曹县人民医院三级乙等综合医院现场评审通过。
2015年12月20日，山东省肛肠病医院曹县分院成立。
