南方科技大学医院坐落于深圳市西丽湖畔、石鼓山旁，是南山区政府投资、南方科技大学运营管理的集医疗、教学、科研、健康促进、人才培养和国际交流为一体的三级综合性公立医院。
医院始建于1985年，深耕南山北部医疗服务三十余年。2017年12月28日，深圳市南山区政府与南方科技大学签署合作共建医院协议，开启了区校合作的新征程。2018年5月，医院由“深圳市西丽人民医院”更名为“南方科技大学医院”，为国内独特的政府主导、大学托管、管办分开、理事会制、法人治理的现代医院运营管理新模式，引进南方科技大学讲席教授裴国献为首的医院管理团队。2019年11月22日，医院晋升为三级综合医院。2020年12月，揭牌“南方科技大学第三附属医院”。医院定位为“立足深圳、服务粤港澳大湾区、辐射东南亚，集医疗、教学、研究与国际化为一体的国内一流、粤港澳前沿、国际先进的综合性大学附属医院”。
医院占地面积2.66万平方米，一期建筑面积近10万平方米，可展开病床800张；目前已启动二期工程建设，未来五年内，将达到总建筑面积22万平方米、1500张床位规模。根据区校合作协议要求，五年内，医院将建成集医疗、教学、科研、人才培养与国际化五位一体的三级甲等综合性大学附属医院。截止2021年11月，医院职工1220人，具有硕士、博士学历301人，卫生专业技术高级职称209人，中级职称502人。开设临床学科36个、医技学科14个。医院大力引进高水平人才，2019-2021年新引进博士64人，硕士144人；引进具有博士学位、教授职称、来自大学附属医院的学科带头人、学科骨干51人；市级以上主委、副主委6人，国家百千万人才工程首批人选1人，国家级有突出贡献专家1人，享受国务院政府特殊津贴1人，深圳市地方级领军人才1人、后备级人才5人、海外C类人才3人、II类实用型临床医学人才1人；博、硕导师26人；教授14人，副教授10人。
医院设有具有国际前沿、国内领先水平的“南方科技大学粤港澳智能与数字外科创新中心”，下设3D打印外科部、虚拟现实临床部、智能外科技术部和外科植入物研发部，立足临床实际理医工融汇交叉，开展系列创新性临床转化研究，致力打通智能与数字外科高精尖技术通向临床应用“最后一公里”的路径问题。在全国率先示范、全职引进国际顶尖医疗团队，组建成“国际骨科部(IOC)”，为深圳市、大湾区、乃至东南亚地区民众提供国际最先进的医疗服务。医院骨科医学部成功开展全球首例混合现实（MR）导航脊柱外科手术、全国首例O形臂辅助天玑机器人脊柱手术等前沿技术。医院静配中心为深圳首家通过广东省PIVAS验收的医院。国内创新设置病人关爱部，探索"患者第一"的医疗理念、服务模式与医患体系，优化患者就医体验，为患者提供全程、全方位的人文关爱服务。医院将以精尖技术引领，国际化医疗为特色，全力打造3-5个技术特色鲜明的学科群。
医院拥有MRI、磁波刀、256排螺旋CT、DSA一体化导管室、双板DR、四维专科高端及全身彩超、全自动生化与血液流水线等大型医疗设备高精尖医疗设备；设有具有国际先进水平的智能数字化手术室、复合手术室、高级模拟人中心、PIVAS 药品自检系统等智能数字化设施，为患者优质服务提供支撑。
医院投入建设临床技能中心，拥有高端综合模拟人SimMan 3G，超级产妇综合模拟人SimMom，新生儿模拟病人SimNewB，腹腔镜手术模拟训练系统等90余种教学模型。2018年中心获美国心脏协会AHA国际培训中心，主要承担本院临床医学各专业的临床技能实践教学，同时也对外开放，接受急救和专业培训课程。
医院目前正处在转型升级、赋能创新、全力提速的发展关键时期，将借力区校合作、理事会制的全新运营管理模式，以创新驱动发展，秉持“厚德、博爱、精医、卓越”的院训；创新管理机制，打造南科医模式；推行“一、二、三、四、五”医院发展战略,即：明确一个定位“小而精、高站位、差异性、国际化”；通过二个举措“人才学科与精尖设备、文化内涵与人性服务”；分为三个步骤“补短板、强特色、塑品牌”；遵循四项策略“创新管理机制、高端设备支撑、精尖技术引领、借力差异发展”；实现“创建三级医院、三甲医院、湾区领先、国内一流、国际知名”五项建设总体目标。
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